Ti år senere besvarer Alice et opkald om at vende tilbage til Eventyrland og genkender knap stedet. Fra svamperåden i svampeskoven til kemien i den gale hattemagerdomæne rådner Wonderland helt ind til kernen. Uforskrækket over det sygelige miljø og den dødelige fare, der omgiver hende, må Alice fortryde kaosset og stræber efter at afsløre den hemmelighed, der hjemsøger hende. Fra Eventyrlandets forskellige riger søger Alice efter svar.
I kamp får Alice et lille antal våben, som kan bruges på forskellige måder. Hans vigtigste våben (og varemærke) er Vorpal Blade, en dekoreret køkkenkniv.